M2 TI - Traitement d'Images

• Objectifs du cours :

Ce cours présentera les différentes modalités liées à l’imagerie biomédicale. Les différents principes d’acquisition de l’image et les méthodes de reconstruction seront exposés. Nous détaillerons les spécificités de chaque modalité selon le sujet d’observation : le corps humain ou l’entité biologique (tissu, cellule, molécule). Quelques exemples d’analyse d’images biologiques seront présentés.

• Programme

Introduction à l’imagerie médicale et biologique : le besoin de l’imagerie.

1. Imagerie médicale :
   • Imagerie par rayons X (radiologie, tomodensitométrie) et méthodes de reconstruction tomographique, …)
   • IRM (anatomique, angiographie, IRMf, )
   • Imagerie nucléaire (SPECT, TEP)
   • Imagerie ultrasonore (2D, 3D, doppler)
2. Imagerie biologique :
   • Pouvoir de résolution : microscopie photonique, microscopie électronique
   • Interaction matière-lumière. Principes de la microscopie photonique :
     • en lumière transmise,
     • en contraste de phase
     • et fluorescence. microscopie confocale (CLSM)
   • Super-résolution : SIM, STED, STORM/PALM
   • Exemple d’applications :
     • Détection et suivi de particules fluorescentes - Segmentation & suivi de cellules
     • Colocalisation

Les séances de TP se feront avec Icy (Icy.bioimageanalysis.org)

• Validation

La validation est effectuée sous la forme d'un mini-projet individuel.